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动物为什么有颜色？火鸡为什么要利用尾羽的色彩？雄性极乐鸟为什么要“翩翩起舞”？达尔文认为，在自然选择与性选择之间存在着某种平衡。根据这个理论，雄性是依靠颜色诱惑雌性的，但是达尔文却不能证实雌性禽类是否真的能看到这些颜色。依靠一些特殊的摄像设备和对不同动物的颜色的解剖学分析证实，雌性的确能分辨出不同颜色，甚至能看到人类无法看到的紫外线区域的色彩。

为什么出现了生物大灭绝？达尔文时代的科学家可以从岩石层中推断出古生代化石生物是如何灭绝的，又如何被中生代化石生物所取代的。他们从中了解到，生物灭绝是一种自然现象。但是，他们却不能了解为什么只有某种动植物消失了，还有一些并没有消失。大约从上世纪50年代开始，地质学家们开始注意到，地球的历史和生命体的历史并非一直保持和谐与进步。实际上，地球曾发生过5到6次生物大灭绝，导致50%以上的动植物消失。可是，生物进化的顽强创造力又使生命体在接下来的时期内复苏，新的生态系统从此建立。 

地球到底多少岁？当达尔文列举出有关地球历史的大量数字时，他对地球年龄的估计是数千万至数亿年。在研究了岩石结构后，达尔文毫不怀疑这些岩石要经过许多年时间才能堆积而成。

事实是，达尔文在其位于英国肯特郡的家附近发现的白粉有数千米的厚度，他由此而推断地球是需要1亿年、甚至更长的时间才能形成的。

但是，那个时代的大多数研究成果和科学家都认为达尔文的这一想法是愚蠢的，因为地球只存在了1000万年的时间，甚至更短。当然，在那个时代这些科学家们也还不知道700万年前最早的一个人种“乍得人”就已出现。在得知这一发现之后，科学界开始回过头去重新核对他们的许多种假说。19世纪90年代，放射性定年法被发现，通过比较某些放射性矿物质的比例，如铀和氩40，就可以证明地球的年龄已经超过了45亿年。因此，达尔文的直觉判断是正确的。

遗传是什么？早在19世纪的时候，人们就知道红头发的父母会生出红头发的孩子，而斑点狗也会繁殖出同种的小狗。但是，那时的人们却不知道为什么会这样。当存在于每个细胞核内的遗传基因密码被发现后，谜底就揭开了。1953年，DNA结构首次被破解，分子生物学因此诞生，时至今日，这门科学已经占据了全世界全部科学研究的一半以上，原 因就是它对生物学、医药学和农业都可以产生影响。而分子生物学的理论基础正是达尔文的进化论。
什么是生命的起源？达尔文是第一个指出所有生命体，无论是细菌，还是人类，苔藓还是栎树，都是从一个共同的祖先进化而来的。但是，他却无法证实这种说法。从1940年开始，大量的化石被陆续鉴定出来，并推断出存在的年份。其中最古老的已经有35亿年的历史，并证明了所有生命体都建立在一个“族谱”之上，它的根基则是一个非常简单的生物体。 

眼睛如何进化？达尔文认为，人类的器官是从非常简单的结构进化而来，然后具有了非常复杂的功能。但是，达尔文的反对者们却提出，功能甚少的眼睛实际上没有什么用处。可是达尔文却认为，功能欠缺总比没有好，比如一些海洋无脊椎动物只能分辨出黑白两色，但这对于它们而言已经足够了。还有一些动物只能捕捉到光，例如蠕虫。世界上只有脊椎动物和头足动物拥有可以调节大小的眼睛，这样方便聚焦。 

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